Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 BSD2YBR290W 966 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 RPN6YDL097C 1305 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 MIS1YBR084W 2928 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 RIA1YNL163C 3333 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 SPT3YDR392W 1014 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 AAD10YJR155W 867 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 RPS1BYML063W 768 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 TPP1YMR156C 717 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 ANT1YPR128C 987 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 PHO12YHR215W 1404 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 PHO11YAR071W 1404 nt3.84□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 KIN4YOR233W 2403 nt3.84□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 USA1YML029W 2517 nt3.84□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 ALG9YNL219C 1668 nt3.84□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 MDL1YLR188W 2088 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 ACE2YLR131C 2313 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 COS7YDL248W 1152 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 YGL193CYGL193C 312 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 YGR015CYGR015C 987 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 BIO2YGR286C 1128 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 COS5YJR161C 1152 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 IDI1YPL117C 867 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 PWR1PWR1 941 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 CNA1YLR433C 1662 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 ECM22YLR228C 2445 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 TRK1YJL129C 3708 nt3.83□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 DIP2YLR129W 2832 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 BCK2YER167W 2556 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 NHX1YDR456W 1902 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 DIT2YDR402C 1470 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 AHA1YDR214W 1053 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 BUR6YER159C 429 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 YPT53YNL093W 663 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 DSC2YOL073C 969 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 GLN4YOR168W 2430 nt3.82□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 RDH54YBR073W 2877 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 RSC3YDR303C 2658 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 OAR1YKL055C 837 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 YNR061CYNR061C 660 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 DSE3YOR264W 1293 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 YER077CYER077C 2067 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 PHO87YCR037C 2772 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 PTA1YAL043C 2358 nt3.81□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 PDR12YPL058C 4536 nt3.8□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 OSH2YDL019C 3852 nt3.8□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 SOF1YLL011W 1470 nt3.8□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt3.8□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 UTP11YKL099C 753 nt3.8□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.8□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 VPS71YML041C 843 nt3.8□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 YMR114CYMR114C 1107 nt3.8□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 GDT1YBR187W 843 nt3.8□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 FAA1YOR317W 2103 nt3.79□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 SPT23YKL020C 3249 nt3.79□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 YER147C-AYER147C-A 411 nt3.79□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 YFR045WYFR045W 930 nt3.79□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 NRK1YNL129W 723 nt3.79□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 FSH3YOR280C 801 nt3.79□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 CMR3YPR013C 954 nt3.79□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.79□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 SIR1YKR101W 1965 nt3.79□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 HER2YMR293C 1395 nt3.78□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 CDC14YFR028C 1656 nt3.78□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 ALG11YNL048W 1647 nt3.78□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 RNY1YPL123C 1305 nt3.78□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 YGL088WYGL088W 366 nt3.78□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 YAE1YJR067C 426 nt3.78□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 ASC1YMR116C 960 nt3.78□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 SNF8YPL002C 702 nt3.78□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 NCR1YPL006W 3513 nt3.78□□□□□ -1.8
RRP42Q12277 GAL11YOL051W 3246 nt3.78□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 NFI1YOR156C 2181 nt3.78□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 UBP6YFR010W 1500 nt3.77□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 NGL3YML118W 1518 nt3.77□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 YCR050CYCR050C 309 nt3.77□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 YGR273CYGR273C 525 nt3.77□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 UPS2YLR168C 693 nt3.77□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 SWC7YLR385C 399 nt3.77□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 YBL036CYBL036C 774 nt3.77□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 RET3YPL010W 570 nt3.77□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 INA17YPL099C 549 nt3.77□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 YBR134WYBR134W 402 nt3.77□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 SRP72YPL210C 1923 nt3.77□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 IDS2YJL146W 1410 nt3.77□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 IOC4YMR044W 1428 nt3.77□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 PRP19YLL036C 1512 nt3.76□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 HIS5YIL116W 1158 nt3.76□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 DAN1YJR150C 897 nt3.76□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 ADD66YKL206C 804 nt3.76□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 RPL19AYBR084C-A 570 nt3.76□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 STP22YCL008C 1158 nt3.76□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 VID28YIL017C 2766 nt3.76□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 NTA1YJR062C 1374 nt3.76□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 ATG2YNL242W 4779 nt3.75□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 GRS2YPR081C 1857 nt3.75□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 FUR1YHR128W 651 nt3.75□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt3.75□□□□□ -1.81
RRP42Q12277 SNL1YIL016W 480 nt3.75□□□□□ -1.81
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