Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 YLL058WYLL058W 1728 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 APE4YHR113W 1473 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 GAS2YLR343W 1668 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 RBS1YDL189W 1374 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 RGT2YDL138W 2292 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 NSI1YDR026C 1713 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 HUR1YGL168W 333 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 SRP40YKR092C 1221 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 ACF2YLR144C 2340 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 GRX3YDR098C 858 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 TMA20YER007C-A 546 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 YIL175WYIL175W 318 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 MED7YOL135C 669 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 UTR2YEL040W 1404 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 GPA1YHR005C 1419 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 LAT1YNL071W 1449 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 STE12YHR084W 2067 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 MRPL7YDR237W 879 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 ZIM17YNL310C 525 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 YOL159CYOL159C 516 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 CTF19YPL018W 1110 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 HEM1YDR232W 1647 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 MSN4YKL062W 1893 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 VBA5YKR105C 1749 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 YDR445CYDR445C 408 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 AAD16YFL057C 459 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 CIA2YHR122W 696 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 YHR214WYHR214W 612 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 PCL7YIL050W 858 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 APN1YKL114C 1104 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 GCN3YKR026C 918 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 YAR066WYAR066W 612 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 RPL31BYLR406C 342 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 YPT7YML001W 627 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 ATG8YBL078C 354 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 ICY2YPL250C 411 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 YOP1YPR028W 543 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 BMT2YBR141C 1014 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 DAL4YIR028W 1908 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 ECM30YLR436C 3825 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 UTP18YJL069C 1785 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BLQ12266 ERC1YHR032W 1746 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 GLN3YER040W 2193 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 MRPS28YDR337W 861 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YGL015CYGL015C 393 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YGR039WYGR039W 312 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 CBR1YIL043C 855 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 MAM33YIL070C 801 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 SOP4YJL192C 705 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 AIM32YML050W 936 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YPL088WYPL088W 1029 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 FRE7YOL152W 1863 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 FCY22YER060W-A 1593 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YDR535CYDR535C 501 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 HIS1YER055C 894 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YJL144WYJL144W 315 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YJR087WYJR087W 351 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YOL160WYOL160W 342 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 VMA4YOR332W 702 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 ECM31YBR176W 939 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 snR41snR41 95 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 COX10YPL172C 1389 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 MIP1YOR330C 3765 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 SUC2YIL162W 1599 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 ECM7YLR443W 1347 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 RRP3YHR065C 1506 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 PYK2YOR347C 1521 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 ADY3YDL239C 2373 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 ARC1YGL105W 1131 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 AIM46YHR199C 933 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 CUE4YML101C 354 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 UBX4YMR067C 1251 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 CIN5YOR028C 888 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YPL225WYPL225W 441 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 MDM34YGL219C 1380 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 CDC1YDR182W 1476 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 RPN4YDL020C 1596 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YCL020WYCL020W 1317 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 GGA1YDR358W 1674 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YDL071CYDL071C 375 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 MRH1YDR033W 963 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 TMT1YER175C 900 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YGL039WYGL039W 1047 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YJR107WYJR107W 987 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YLR171WYLR171W 390 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 MAP2YBL091C 1266 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 OPY1YBR129C 987 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 HXT3YDR345C 1704 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 UGO1YDR470C 1509 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 PLB3YOL011W 2061 nt5.98□□□□□ -1.45
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