Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 HPM1YIL110W 1134 nt4.56□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YJR071WYJR071W 369 nt4.56□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 PER33YLR064W 822 nt4.56□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt4.56□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt4.56□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 CSI1YMR025W 888 nt4.56□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YNR061CYNR061C 660 nt4.56□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 CMR3YPR013C 954 nt4.56□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 ALG1YBR110W 1350 nt4.55□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 TAF5YBR198C 2397 nt4.55□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 GLE2YER107C 1098 nt4.55□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 NPY1YGL067W 1155 nt4.55□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt4.55□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YJR085CYJR085C 318 nt4.55□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YKL177WYKL177W 339 nt4.55□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 MTR2YKL186C 555 nt4.55□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 MRP2YPR166C 348 nt4.55□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 GDT1YBR187W 843 nt4.55□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 APC1YNL172W 5247 nt4.55□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 RRB1YMR131C 1536 nt4.55□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 PXA1YPL147W 2613 nt4.55□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 NPL4YBR170C 1743 nt4.55□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 MET12YPL023C 1974 nt4.54□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 PEX29YDR479C 1665 nt4.54□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 CRT10YOL063C 2874 nt4.54□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 CTH1YDR151C 978 nt4.54□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 CBS2YDR197W 1170 nt4.54□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YER145C-AYER145C-A 438 nt4.54□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 COG7YGL005C 840 nt4.54□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 PEX21YGR239C 867 nt4.54□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YLR346CYLR346C 306 nt4.54□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YOR114WYOR114W 885 nt4.54□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YBR013CYBR013C 390 nt4.54□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 PGM2YMR105C 1710 nt4.54□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 SNF3YDL194W 2655 nt4.54□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YGR125WYGR125W 3111 nt4.54□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 SER3YER081W 1410 nt4.54□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt4.53□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 HIS6YIL020C 786 nt4.53□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YIL165CYIL165C 360 nt4.53□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YJR096WYJR096W 849 nt4.53□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 CMC1YKL137W 336 nt4.53□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 GPN3YLR243W 819 nt4.53□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 CSM3YMR048W 954 nt4.53□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 RRN9YMR270C 1098 nt4.53□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 IPP1YBR011C 864 nt4.53□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 PRP31YGR091W 1485 nt4.53□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 ZPR1YGR211W 1461 nt4.53□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 MDL1YLR188W 2088 nt4.53□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 LYP1YNL268W 1836 nt4.53□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 GSY1YFR015C 2127 nt4.52□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 SAD1YFR005C 1347 nt4.52□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 LHP1YDL051W 828 nt4.52□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 UBC5YDR059C 447 nt4.52□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 ECT1YGR007W 972 nt4.52□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 PCD1YLR151C 1023 nt4.52□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 YLR156WYLR156W 345 nt4.52□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 YLR159WYLR159W 345 nt4.52□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 YLR161WYLR161W 345 nt4.52□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 SPC2YML055W 537 nt4.52□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 RRG9YNL213C 645 nt4.52□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 VPS21YOR089C 633 nt4.52□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 YOR379CYOR379C 339 nt4.52□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 LDH1YBR204C 1128 nt4.52□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 VID22YLR373C 2706 nt4.51□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 YGR122WYGR122W 1209 nt4.51□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 GRE1YPL223C 507 nt4.51□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 SPP381YBR152W 876 nt4.51□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 RPS9BYBR189W 588 nt4.51□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 SEC39YLR440C 2130 nt4.51□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 GDH2YDL215C 3279 nt4.5□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 SUM1YDR310C 3189 nt4.5□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 CAB3YKL088W 1716 nt4.5□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 FRT2YAL028W 1587 nt4.5□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 BNA6YFR047C 888 nt4.5□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 TEF4YKL081W 1239 nt4.5□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 PML39YML107C 1005 nt4.5□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 YPR027CYPR027C 834 nt4.5□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 MCM4YPR019W 2802 nt4.5□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 DIT2YDR402C 1470 nt4.49□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 ASK10YGR097W 3441 nt4.49□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 snR7-LsnR7-L 214 nt4.49□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 YFL012WYFL012W 447 nt4.49□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt4.49□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 NKP2YLR315W 462 nt4.49□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 RIF2YLR453C 1188 nt4.49□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 ERD2YBL040C 660 nt4.49□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 COG5YNL051W 1212 nt4.49□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 UFE1YOR075W 1041 nt4.49□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 PNO1YOR145C 825 nt4.49□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 ARA1YBR149W 1035 nt4.49□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 Q0017Q0017 162 nt4.49□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 VHS2YIL135C 1311 nt4.48□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 RDI1YDL135C 609 nt4.48□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 TRM8YDL201W 861 nt4.48□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 TYS1YGR185C 1185 nt4.48□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 URA5YML106W 681 nt4.48□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 FYV6YNL133C 522 nt4.48□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 CDC21YOR074C 915 nt4.48□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 SPN1YPR133C 1233 nt4.48□□□□□ -1.69
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