Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 GPI13YLL031C 3054 nt4.27□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 HOYDL227C 1761 nt4.27□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 UBP6YFR010W 1500 nt4.27□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 UPC2YDR213W 2742 nt4.27□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 PPQ1YPL179W 1650 nt4.27□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 YDL183CYDL183C 963 nt4.27□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 AI5_BETAQ0075 1065 nt4.27□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 AAD10YJR155W 867 nt4.27□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 COX19YLL018C-A 297 nt4.27□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 YAR030CYAR030C 342 nt4.27□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 TOM7YNL070W 183 nt4.27□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 MDM12YOL009C 816 nt4.27□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 YPL014WYPL014W 1146 nt4.27□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 PHO12YHR215W 1404 nt4.27□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 PHO11YAR071W 1404 nt4.27□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 YOL153CYOL153C 1746 nt4.26□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 BOI2YER114C 3123 nt4.26□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 NUP133YKR082W 3474 nt4.26□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 UBP10YNL186W 2379 nt4.26□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 SOF1YLL011W 1470 nt4.26□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 VPS53YJL029C 2469 nt4.26□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 PHO13YDL236W 939 nt4.26□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 PRM9YAR031W 897 nt4.26□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 YMR130WYMR130W 909 nt4.26□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt4.26□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 IDS2YJL146W 1410 nt4.26□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 SEN1YLR430W 6696 nt4.26□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 THI13YDL244W 1023 nt4.25□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 THI11YJR156C 1023 nt4.25□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 MCP2YLR253W 1710 nt4.25□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 PEX30YLR324W 1572 nt4.25□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 SWC7YLR385C 399 nt4.25□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 TDA5YLR426W 981 nt4.25□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 YNR061CYNR061C 660 nt4.25□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 snR37snR37 386 nt4.25□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 MRPL7YDR237W 879 nt4.24□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 WSS1YHR134W 810 nt4.24□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 HIS5YIL116W 1158 nt4.24□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 SEC72YLR292C 582 nt4.24□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 NRG2YBR066C 663 nt4.24□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 GGA1YDR358W 1674 nt4.24□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 ARX1YDR101C 1782 nt4.24□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 UGA3YDL170W 1587 nt4.23□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 ATG32YIL146C 1590 nt4.23□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 HFD1YMR110C 1599 nt4.23□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 YSH1YLR277C 2340 nt4.23□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 DHH1YDL160C 1521 nt4.23□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 RMD1YDL001W 1293 nt4.23□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 RPP1AYDL081C 321 nt4.23□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 FMP32YFL046W 624 nt4.23□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 FOL2YGR267C 732 nt4.23□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 YLL017WYLL017W 312 nt4.23□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 YMR085WYMR085W 1299 nt4.23□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 CTR1YPR124W 1221 nt4.23□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 MSN4YKL062W 1893 nt4.23□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 CHL1YPL008W 2586 nt4.23□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 PMC1YGL006W 3522 nt4.23□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 BCH2YKR027W 2298 nt4.22□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 MRPL25YGR076C 474 nt4.22□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 YAE1YJR067C 426 nt4.22□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 ELF1YKL160W 438 nt4.22□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 RPS1BYML063W 768 nt4.22□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 RPL19BYBL027W 570 nt4.22□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 YPT53YNL093W 663 nt4.22□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 PBN1YCL052C 1251 nt4.22□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 SYF1YDR416W 2580 nt4.22□□□□□ -1.73
TY3A-GQ12173 BCP1YDR361C 852 nt4.21□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 YEL074WYEL074W 339 nt4.21□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 YER067C-AYER067C-A 324 nt4.21□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 YHR112CYHR112C 1137 nt4.21□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 OAR1YKL055C 837 nt4.21□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 ELO3YLR372W 1038 nt4.21□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 YPL025CYPL025C 558 nt4.21□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 EFM2YBR271W 1260 nt4.21□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 SSU1YPL092W 1377 nt4.21□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 MTH1YDR277C 1302 nt4.21□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 ALG9YNL219C 1668 nt4.2□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 YDR132CYDR132C 1488 nt4.2□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 PUB1YNL016W 1362 nt4.2□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 RPA14YDR156W 414 nt4.2□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 PAU10YDR542W 363 nt4.2□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 SLX8YER116C 825 nt4.2□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 PAU11YGL261C 363 nt4.2□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 PAU13YHL046C 363 nt4.2□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 BNA1YJR025C 534 nt4.2□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 SPC42YKL042W 1092 nt4.2□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 YLR122CYLR122C 378 nt4.2□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 PAU4YLR461W 363 nt4.2□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 YPL077CYPL077C 723 nt4.2□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 IDI1YPL117C 867 nt4.2□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 RNA14YMR061W 2034 nt4.2□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 ARO1YDR127W 4767 nt4.19□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt4.19□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 MRT4YKL009W 711 nt4.19□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 RPS19AYOL121C 435 nt4.19□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 YOR289WYOR289W 756 nt4.19□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt4.19□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 YPK9YOR291W 4419 nt4.19□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 HOS3YPL116W 2094 nt4.18□□□□□ -1.74
TY3A-GQ12173 RSF2YJR127C 4143 nt4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.3 ms