Protein–RNA interactions for Protein: Q12149

RRP6, Exosome complex exonuclease RRP6, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP6Q12149 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.93□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.93□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.93□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.93□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.93□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.93□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 YGR168CYGR168C 1131 nt4.93□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 ARC15YIL062C 465 nt4.93□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 NMA1YLR328W 1206 nt4.93□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 YMR130WYMR130W 909 nt4.93□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 TFB6YOR352W 1032 nt4.93□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 MUM2YBR057C 1101 nt4.93□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt4.93□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 GLN4YOR168W 2430 nt4.93□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 BCH2YKR027W 2298 nt4.93□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 EAR1YMR171C 1653 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 SRS2YJL092W 3525 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 IMA3YIL172C 1770 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 IMA4YJL221C 1770 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 YDL027CYDL027C 1263 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 ARF2YDL137W 546 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 RNH202YDR279W 1053 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 JAC1YGL018C 555 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 TYW3YGL050W 822 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 ARI1YGL157W 1044 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 AAD10YJR155W 867 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 KTR2YKR061W 1278 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 YLR042CYLR042C 486 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 SIC1YLR079W 855 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 MTG1YMR097C 1104 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 SUT2YPR009W 807 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 UMP1YBR173C 447 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 CBF5YLR175W 1452 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 CDC48YDL126C 2508 nt4.92□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 SAP4YGL229C 2457 nt4.91□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 APP1YNL094W 1764 nt4.91□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 MNN11YJL183W 1269 nt4.91□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 MTD1YKR080W 963 nt4.91□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 MMM1YLL006W 1281 nt4.91□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 YML090WYML090W 387 nt4.91□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 ATG16YMR159C 453 nt4.91□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 RPS10BYMR230W 318 nt4.91□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 ATG19YOL082W 1248 nt4.91□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 CYC2YOR037W 1101 nt4.91□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 YPR142CYPR142C 564 nt4.91□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 TGL4YKR089C 2733 nt4.91□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 YGR266WYGR266W 2106 nt4.91□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 MGR3YMR115W 1506 nt4.91□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 YRB30YGL164C 1323 nt4.91□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 PHO87YCR037C 2772 nt4.91□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 SPB4YFL002C 1821 nt4.9□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 PMS1YNL082W 2622 nt4.9□□□□□ -1.62
RRP6Q12149 YCR016WYCR016W 873 nt4.9□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 PAN5YHR063C 1140 nt4.9□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 YIL025CYIL025C 375 nt4.9□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 COA3YJL062W-A 258 nt4.9□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 TVP38YKR088C 1014 nt4.9□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 FBP1YLR377C 1047 nt4.9□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 YIF1YNL263C 945 nt4.9□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 KAR1YNL188W 1302 nt4.9□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 NMD3YHR170W 1557 nt4.9□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 PTM1YKL039W 1572 nt4.9□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 UBP10YNL186W 2379 nt4.9□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 MSC2YDR205W 2175 nt4.89□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 NUP2YLR335W 2163 nt4.89□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 MDR1YGR100W 2853 nt4.89□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 PHO13YDL236W 939 nt4.89□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4.89□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 YGR016WYGR016W 573 nt4.89□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 LSO1YJR005C-A 282 nt4.89□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 GAT3YLR013W 426 nt4.89□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 CDC21YOR074C 915 nt4.89□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 YBR016WYBR016W 387 nt4.89□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 ATG29YPL166W 642 nt4.89□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt4.89□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 PUT2YHR037W 1728 nt4.89□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 ALG6YOR002W 1635 nt4.88□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 YDR124WYDR124W 975 nt4.88□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 YLR311CYLR311C 348 nt4.88□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 YIP3YNL044W 531 nt4.88□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 CTK1YKL139W 1587 nt4.87□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 CTT1YGR088W 1689 nt4.87□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 ABF1YKL112W 2196 nt4.87□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 YCL076WYCL076W 744 nt4.87□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 SHU2YDR078C 672 nt4.87□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 RPL34AYER056C-A 366 nt4.87□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 DCG1YIR030C 735 nt4.87□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 YOR338WYOR338W 1092 nt4.87□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 YBR089WYBR089W 600 nt4.87□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 AME1YBR211C 975 nt4.87□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.87□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 IMD2YHR216W 1572 nt4.87□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 THI7YLR237W 1797 nt4.86□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 GAD1YMR250W 1758 nt4.86□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 YUH1YJR099W 711 nt4.86□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 POP8YBL018C 402 nt4.86□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 POC4YPL144W 447 nt4.86□□□□□ -1.63
RRP6Q12149 IDS2YJL146W 1410 nt4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.7 ms