Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
GOLGA3Q08378 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
GOLGA3Q08378 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms