Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB2Q08289 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms