Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX9Q08211 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms