Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms