Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms