Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD51Q06609 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51Q06609 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms