Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RELAQ04206 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RELAQ04206 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RELAQ04206 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RELAQ04206 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RELAQ04206 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RELAQ04206 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RELAQ04206 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RELAQ04206 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RELAQ04206 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RELAQ04206 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RELAQ04206 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RELAQ04206 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RELAQ04206 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RELAQ04206 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RELAQ04206 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RELAQ04206 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RELAQ04206 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RELAQ04206 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RELAQ04206 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RELAQ04206 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RELAQ04206 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RELAQ04206 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RELAQ04206 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RELAQ04206 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RELAQ04206 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RELAQ04206 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RELAQ04206 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RELAQ04206 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RELAQ04206 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RELAQ04206 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RELAQ04206 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RELAQ04206 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RELAQ04206 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RELAQ04206 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RELAQ04206 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RELAQ04206 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RELAQ04206 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RELAQ04206 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RELAQ04206 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RELAQ04206 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RELAQ04206 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RELAQ04206 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RELAQ04206 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RELAQ04206 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RELAQ04206 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RELAQ04206 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RELAQ04206 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RELAQ04206 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RELAQ04206 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RELAQ04206 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RELAQ04206 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RELAQ04206 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RELAQ04206 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RELAQ04206 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RELAQ04206 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RELAQ04206 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RELAQ04206 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RELAQ04206 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RELAQ04206 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RELAQ04206 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RELAQ04206 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RELAQ04206 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RELAQ04206 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RELAQ04206 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RELAQ04206 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RELAQ04206 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RELAQ04206 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RELAQ04206 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RELAQ04206 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RELAQ04206 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RELAQ04206 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RELAQ04206 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RELAQ04206 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RELAQ04206 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RELAQ04206 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RELAQ04206 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RELAQ04206 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RELAQ04206 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RELAQ04206 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RELAQ04206 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RELAQ04206 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RELAQ04206 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RELAQ04206 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RELAQ04206 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RELAQ04206 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RELAQ04206 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RELAQ04206 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RELAQ04206 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RELAQ04206 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RELAQ04206 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RELAQ04206 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RELAQ04206 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RELAQ04206 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RELAQ04206 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RELAQ04206 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RELAQ04206 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RELAQ04206 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms