Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NUCB1Q02818 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms