Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNB1Q02641 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms