Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DSG1Q02413 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms