Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF17Q02223 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms