Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF9Q00978 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms