Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms