Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTD2P86397 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTD2P86397 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTD2P86397 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTD2P86397 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTD2P86397 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTD2P86397 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTD2P86397 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HTD2P86397 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTD2P86397 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTD2P86397 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTD2P86397 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTD2P86397 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTD2P86397 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTD2P86397 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTD2P86397 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTD2P86397 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTD2P86397 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTD2P86397 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTD2P86397 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTD2P86397 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTD2P86397 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTD2P86397 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTD2P86397 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTD2P86397 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTD2P86397 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTD2P86397 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTD2P86397 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTD2P86397 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTD2P86397 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTD2P86397 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTD2P86397 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTD2P86397 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTD2P86397 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTD2P86397 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTD2P86397 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTD2P86397 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTD2P86397 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTD2P86397 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTD2P86397 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTD2P86397 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTD2P86397 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTD2P86397 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTD2P86397 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HTD2P86397 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTD2P86397 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTD2P86397 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTD2P86397 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTD2P86397 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTD2P86397 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTD2P86397 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTD2P86397 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTD2P86397 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTD2P86397 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTD2P86397 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTD2P86397 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTD2P86397 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTD2P86397 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HTD2P86397 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTD2P86397 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTD2P86397 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTD2P86397 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HTD2P86397 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HTD2P86397 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTD2P86397 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTD2P86397 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTD2P86397 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTD2P86397 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTD2P86397 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTD2P86397 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTD2P86397 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTD2P86397 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTD2P86397 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTD2P86397 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTD2P86397 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTD2P86397 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms