Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRX1P78414 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRX1P78414 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRX1P78414 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IRX1P78414 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRX1P78414 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRX1P78414 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRX1P78414 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRX1P78414 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRX1P78414 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRX1P78414 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRX1P78414 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRX1P78414 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRX1P78414 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRX1P78414 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRX1P78414 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRX1P78414 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRX1P78414 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRX1P78414 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRX1P78414 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRX1P78414 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRX1P78414 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRX1P78414 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRX1P78414 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRX1P78414 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRX1P78414 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRX1P78414 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRX1P78414 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRX1P78414 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRX1P78414 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRX1P78414 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRX1P78414 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRX1P78414 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRX1P78414 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRX1P78414 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRX1P78414 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRX1P78414 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRX1P78414 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRX1P78414 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRX1P78414 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRX1P78414 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRX1P78414 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRX1P78414 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRX1P78414 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRX1P78414 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRX1P78414 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRX1P78414 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRX1P78414 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRX1P78414 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRX1P78414 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRX1P78414 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRX1P78414 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRX1P78414 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IRX1P78414 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRX1P78414 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRX1P78414 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRX1P78414 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRX1P78414 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRX1P78414 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRX1P78414 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRX1P78414 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRX1P78414 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRX1P78414 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRX1P78414 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRX1P78414 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRX1P78414 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRX1P78414 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRX1P78414 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRX1P78414 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRX1P78414 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRX1P78414 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRX1P78414 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRX1P78414 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRX1P78414 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX1P78414 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX1P78414 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX1P78414 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX1P78414 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX1P78414 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX1P78414 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX1P78414 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX1P78414 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX1P78414 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX1P78414 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX1P78414 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX1P78414 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX1P78414 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX1P78414 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX1P78414 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX1P78414 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX1P78414 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX1P78414 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX1P78414 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX1P78414 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX1P78414 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX1P78414 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX1P78414 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX1P78414 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX1P78414 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX1P78414 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms