Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBBP68871 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBBP68871 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBBP68871 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBBP68871 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBBP68871 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBBP68871 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBBP68871 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBBP68871 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBBP68871 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HBBP68871 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HBBP68871 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HBBP68871 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HBBP68871 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HBBP68871 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HBBP68871 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HBBP68871 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HBBP68871 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HBBP68871 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HBBP68871 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HBBP68871 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HBBP68871 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HBBP68871 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HBBP68871 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HBBP68871 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HBBP68871 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HBBP68871 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HBBP68871 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HBBP68871 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HBBP68871 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HBBP68871 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HBBP68871 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HBBP68871 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HBBP68871 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HBBP68871 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HBBP68871 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HBBP68871 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HBBP68871 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HBBP68871 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBBP68871 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBBP68871 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBBP68871 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBBP68871 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBBP68871 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBBP68871 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBBP68871 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBBP68871 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBBP68871 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBBP68871 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBBP68871 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBBP68871 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBBP68871 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HBBP68871 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBBP68871 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBBP68871 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBBP68871 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBBP68871 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBBP68871 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBBP68871 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBBP68871 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms