Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAMP2P63027 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAMP2P63027 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAMP2P63027 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAMP2P63027 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAMP2P63027 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAMP2P63027 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAMP2P63027 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAMP2P63027 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAMP2P63027 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAMP2P63027 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAMP2P63027 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP2P63027 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms