Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBE2HP62256 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2HP62256 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms