Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS3AP61247 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms