Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTBP60709 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTBP60709 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTBP60709 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTBP60709 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTBP60709 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTBP60709 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTBP60709 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTBP60709 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTBP60709 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTBP60709 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTBP60709 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTBP60709 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACTBP60709 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACTBP60709 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTBP60709 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTBP60709 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTBP60709 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTBP60709 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTBP60709 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTBP60709 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTBP60709 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTBP60709 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTBP60709 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTBP60709 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTBP60709 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTBP60709 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTBP60709 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTBP60709 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTBP60709 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTBP60709 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTBP60709 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTBP60709 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTBP60709 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTBP60709 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTBP60709 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTBP60709 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTBP60709 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTBP60709 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTBP60709 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTBP60709 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTBP60709 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTBP60709 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTBP60709 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTBP60709 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTBP60709 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTBP60709 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTBP60709 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTBP60709 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTBP60709 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTBP60709 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTBP60709 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTBP60709 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTBP60709 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTBP60709 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTBP60709 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTBP60709 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTBP60709 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTBP60709 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTBP60709 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTBP60709 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTBP60709 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTBP60709 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTBP60709 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTBP60709 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTBP60709 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTBP60709 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTBP60709 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTBP60709 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTBP60709 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTBP60709 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTBP60709 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTBP60709 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTBP60709 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTBP60709 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTBP60709 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTBP60709 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTBP60709 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTBP60709 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTBP60709 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTBP60709 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms