Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVPABLB-1P60509 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms