Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EEFSECP57772 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEFSECP57772 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms