Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSCP56915 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSCP56915 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GSCP56915 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSCP56915 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSCP56915 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSCP56915 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSCP56915 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSCP56915 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSCP56915 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSCP56915 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSCP56915 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GSCP56915 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GSCP56915 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GSCP56915 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GSCP56915 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSCP56915 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSCP56915 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSCP56915 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSCP56915 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSCP56915 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSCP56915 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSCP56915 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSCP56915 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSCP56915 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSCP56915 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSCP56915 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSCP56915 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSCP56915 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSCP56915 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSCP56915 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSCP56915 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSCP56915 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSCP56915 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSCP56915 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSCP56915 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSCP56915 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSCP56915 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSCP56915 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSCP56915 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSCP56915 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSCP56915 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GSCP56915 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GSCP56915 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSCP56915 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSCP56915 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSCP56915 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSCP56915 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSCP56915 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSCP56915 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSCP56915 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSCP56915 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSCP56915 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSCP56915 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSCP56915 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSCP56915 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSCP56915 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSCP56915 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSCP56915 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSCP56915 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSCP56915 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSCP56915 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSCP56915 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSCP56915 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSCP56915 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSCP56915 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSCP56915 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSCP56915 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSCP56915 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSCP56915 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSCP56915 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSCP56915 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSCP56915 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSCP56915 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSCP56915 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSCP56915 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSCP56915 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSCP56915 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSCP56915 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSCP56915 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSCP56915 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSCP56915 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSCP56915 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSCP56915 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSCP56915 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSCP56915 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSCP56915 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSCP56915 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSCP56915 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GSCP56915 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSCP56915 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GSCP56915 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSCP56915 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSCP56915 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSCP56915 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSCP56915 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSCP56915 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSCP56915 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSCP56915 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSCP56915 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms