Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NME5P56597 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NME5P56597 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME5P56597 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME5P56597 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME5P56597 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NME5P56597 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NME5P56597 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME5P56597 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NME5P56597 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME5P56597 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NME5P56597 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NME5P56597 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME5P56597 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NME5P56597 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME5P56597 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME5P56597 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NME5P56597 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME5P56597 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME5P56597 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME5P56597 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NME5P56597 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME5P56597 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME5P56597 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME5P56597 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME5P56597 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME5P56597 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME5P56597 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NME5P56597 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME5P56597 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NME5P56597 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NME5P56597 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME5P56597 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NME5P56597 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME5P56597 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME5P56597 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME5P56597 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NME5P56597 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NME5P56597 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME5P56597 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NME5P56597 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NME5P56597 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NME5P56597 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NME5P56597 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NME5P56597 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME5P56597 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME5P56597 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME5P56597 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME5P56597 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME5P56597 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NME5P56597 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NME5P56597 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME5P56597 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME5P56597 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NME5P56597 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME5P56597 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NME5P56597 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NME5P56597 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NME5P56597 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NME5P56597 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME5P56597 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME5P56597 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NME5P56597 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME5P56597 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME5P56597 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME5P56597 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME5P56597 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NME5P56597 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME5P56597 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME5P56597 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME5P56597 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME5P56597 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME5P56597 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME5P56597 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME5P56597 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME5P56597 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME5P56597 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NME5P56597 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME5P56597 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME5P56597 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME5P56597 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME5P56597 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME5P56597 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME5P56597 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME5P56597 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME5P56597 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME5P56597 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME5P56597 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME5P56597 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME5P56597 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME5P56597 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME5P56597 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME5P56597 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME5P56597 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME5P56597 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME5P56597 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME5P56597 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME5P56597 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME5P56597 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME5P56597 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms