Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTCP1P56278 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTCP1P56278 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTCP1P56278 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTCP1P56278 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTCP1P56278 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTCP1P56278 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTCP1P56278 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MTCP1P56278 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTCP1P56278 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTCP1P56278 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTCP1P56278 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTCP1P56278 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTCP1P56278 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms