Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEMP55040 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GEMP55040 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEMP55040 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEMP55040 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEMP55040 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEMP55040 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEMP55040 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEMP55040 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEMP55040 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GEMP55040 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEMP55040 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEMP55040 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEMP55040 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEMP55040 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEMP55040 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GEMP55040 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEMP55040 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEMP55040 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEMP55040 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEMP55040 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEMP55040 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEMP55040 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEMP55040 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEMP55040 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEMP55040 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEMP55040 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEMP55040 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEMP55040 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEMP55040 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEMP55040 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEMP55040 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEMP55040 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GEMP55040 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GEMP55040 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GEMP55040 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GEMP55040 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GEMP55040 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GEMP55040 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GEMP55040 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GEMP55040 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GEMP55040 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GEMP55040 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GEMP55040 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GEMP55040 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GEMP55040 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GEMP55040 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GEMP55040 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GEMP55040 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GEMP55040 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GEMP55040 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GEMP55040 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GEMP55040 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GEMP55040 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GEMP55040 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GEMP55040 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GEMP55040 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GEMP55040 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GEMP55040 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GEMP55040 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GEMP55040 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GEMP55040 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GEMP55040 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GEMP55040 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GEMP55040 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GEMP55040 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GEMP55040 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GEMP55040 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GEMP55040 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GEMP55040 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEMP55040 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GEMP55040 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GEMP55040 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEMP55040 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEMP55040 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEMP55040 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEMP55040 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEMP55040 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GEMP55040 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEMP55040 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEMP55040 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEMP55040 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEMP55040 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEMP55040 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEMP55040 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEMP55040 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEMP55040 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEMP55040 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEMP55040 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEMP55040 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEMP55040 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEMP55040 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GEMP55040 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GEMP55040 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GEMP55040 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GEMP55040 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GEMP55040 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GEMP55040 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GEMP55040 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GEMP55040 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms