Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AIF1P55008 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AIF1P55008 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AIF1P55008 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AIF1P55008 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AIF1P55008 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AIF1P55008 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AIF1P55008 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AIF1P55008 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AIF1P55008 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AIF1P55008 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AIF1P55008 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AIF1P55008 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AIF1P55008 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AIF1P55008 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AIF1P55008 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AIF1P55008 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AIF1P55008 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AIF1P55008 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AIF1P55008 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AIF1P55008 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AIF1P55008 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AIF1P55008 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AIF1P55008 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AIF1P55008 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AIF1P55008 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AIF1P55008 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AIF1P55008 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AIF1P55008 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AIF1P55008 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AIF1P55008 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AIF1P55008 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AIF1P55008 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AIF1P55008 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AIF1P55008 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AIF1P55008 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AIF1P55008 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AIF1P55008 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AIF1P55008 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AIF1P55008 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AIF1P55008 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AIF1P55008 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AIF1P55008 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AIF1P55008 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AIF1P55008 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AIF1P55008 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AIF1P55008 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AIF1P55008 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AIF1P55008 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIF1P55008 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIF1P55008 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIF1P55008 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIF1P55008 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIF1P55008 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIF1P55008 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIF1P55008 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIF1P55008 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIF1P55008 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIF1P55008 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIF1P55008 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIF1P55008 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIF1P55008 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AIF1P55008 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIF1P55008 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIF1P55008 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIF1P55008 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AIF1P55008 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AIF1P55008 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AIF1P55008 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AIF1P55008 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AIF1P55008 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AIF1P55008 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AIF1P55008 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AIF1P55008 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AIF1P55008 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AIF1P55008 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AIF1P55008 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AIF1P55008 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AIF1P55008 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AIF1P55008 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AIF1P55008 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AIF1P55008 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AIF1P55008 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AIF1P55008 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AIF1P55008 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AIF1P55008 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AIF1P55008 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AIF1P55008 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AIF1P55008 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AIF1P55008 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AIF1P55008 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AIF1P55008 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AIF1P55008 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AIF1P55008 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AIF1P55008 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AIF1P55008 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AIF1P55008 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AIF1P55008 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AIF1P55008 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AIF1P55008 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms