Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms