Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1B3P54709 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1B3P54709 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms