Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBE2E1P51965 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2E1P51965 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms