Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC40.19■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC40.19■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
SMARCA4P51532 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC40.12■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms