Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSK3BP49841 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms