Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PRIM1P49642 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms