Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPINT3P49223 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms