Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALDH9A1P49189 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALDH9A1P49189 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms