Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD2P49005 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD2P49005 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD2P49005 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD2P49005 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD2P49005 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD2P49005 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD2P49005 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD2P49005 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD2P49005 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD2P49005 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD2P49005 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD2P49005 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD2P49005 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD2P49005 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD2P49005 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD2P49005 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD2P49005 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD2P49005 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD2P49005 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD2P49005 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD2P49005 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD2P49005 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD2P49005 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD2P49005 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD2P49005 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD2P49005 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD2P49005 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD2P49005 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD2P49005 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD2P49005 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD2P49005 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD2P49005 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD2P49005 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD2P49005 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD2P49005 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD2P49005 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD2P49005 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD2P49005 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD2P49005 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD2P49005 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD2P49005 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD2P49005 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD2P49005 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD2P49005 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD2P49005 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD2P49005 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD2P49005 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD2P49005 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD2P49005 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD2P49005 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLD2P49005 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
POLD2P49005 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLD2P49005 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLD2P49005 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD2P49005 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD2P49005 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD2P49005 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD2P49005 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD2P49005 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD2P49005 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD2P49005 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD2P49005 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD2P49005 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD2P49005 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD2P49005 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD2P49005 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD2P49005 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD2P49005 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD2P49005 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD2P49005 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD2P49005 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD2P49005 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD2P49005 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD2P49005 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD2P49005 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD2P49005 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD2P49005 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD2P49005 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD2P49005 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD2P49005 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD2P49005 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD2P49005 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD2P49005 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD2P49005 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD2P49005 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD2P49005 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD2P49005 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD2P49005 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD2P49005 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD2P49005 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD2P49005 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD2P49005 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD2P49005 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD2P49005 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD2P49005 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD2P49005 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD2P49005 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD2P49005 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD2P49005 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms