Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSNK1DP48730 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms