Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARCN1P48444 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCN1P48444 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms