Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms