Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRCC3P46736 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms