Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RECQLP46063 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RECQLP46063 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RECQLP46063 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RECQLP46063 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RECQLP46063 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RECQLP46063 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RECQLP46063 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RECQLP46063 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RECQLP46063 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RECQLP46063 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RECQLP46063 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RECQLP46063 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RECQLP46063 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RECQLP46063 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RECQLP46063 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RECQLP46063 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RECQLP46063 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RECQLP46063 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RECQLP46063 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RECQLP46063 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RECQLP46063 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RECQLP46063 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RECQLP46063 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RECQLP46063 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RECQLP46063 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RECQLP46063 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RECQLP46063 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RECQLP46063 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RECQLP46063 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RECQLP46063 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RECQLP46063 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RECQLP46063 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RECQLP46063 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RECQLP46063 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RECQLP46063 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RECQLP46063 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RECQLP46063 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RECQLP46063 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RECQLP46063 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RECQLP46063 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RECQLP46063 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RECQLP46063 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RECQLP46063 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RECQLP46063 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RECQLP46063 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RECQLP46063 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RECQLP46063 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RECQLP46063 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RECQLP46063 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RECQLP46063 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RECQLP46063 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RECQLP46063 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RECQLP46063 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RECQLP46063 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RECQLP46063 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RECQLP46063 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RECQLP46063 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RECQLP46063 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RECQLP46063 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RECQLP46063 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RECQLP46063 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RECQLP46063 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RECQLP46063 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RECQLP46063 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RECQLP46063 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RECQLP46063 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RECQLP46063 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RECQLP46063 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RECQLP46063 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RECQLP46063 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RECQLP46063 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RECQLP46063 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RECQLP46063 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RECQLP46063 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RECQLP46063 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RECQLP46063 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RECQLP46063 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RECQLP46063 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RECQLP46063 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RECQLP46063 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RECQLP46063 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RECQLP46063 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RECQLP46063 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RECQLP46063 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RECQLP46063 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RECQLP46063 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RECQLP46063 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RECQLP46063 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RECQLP46063 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RECQLP46063 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RECQLP46063 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RECQLP46063 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RECQLP46063 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RECQLP46063 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RECQLP46063 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RECQLP46063 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RECQLP46063 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RECQLP46063 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RECQLP46063 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms