Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP5P45974 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP5P45974 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP5P45974 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP5P45974 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP5P45974 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP5P45974 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP5P45974 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP5P45974 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP5P45974 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP5P45974 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP5P45974 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP5P45974 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP5P45974 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
USP5P45974 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
USP5P45974 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP5P45974 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP5P45974 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP5P45974 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP5P45974 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP5P45974 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP5P45974 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP5P45974 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP5P45974 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP5P45974 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP5P45974 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP5P45974 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
USP5P45974 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP5P45974 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP5P45974 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP5P45974 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP5P45974 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP5P45974 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP5P45974 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP5P45974 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP5P45974 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP5P45974 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP5P45974 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP5P45974 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP5P45974 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
USP5P45974 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
USP5P45974 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP5P45974 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP5P45974 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP5P45974 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP5P45974 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP5P45974 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP5P45974 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP5P45974 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP5P45974 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP5P45974 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP5P45974 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP5P45974 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP5P45974 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP5P45974 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP5P45974 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP5P45974 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP5P45974 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP5P45974 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP5P45974 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP5P45974 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP5P45974 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP5P45974 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP5P45974 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP5P45974 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP5P45974 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
USP5P45974 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP5P45974 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP5P45974 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP5P45974 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP5P45974 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP5P45974 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP5P45974 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP5P45974 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP5P45974 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP5P45974 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
USP5P45974 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
USP5P45974 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP5P45974 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP5P45974 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP5P45974 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP5P45974 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP5P45974 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP5P45974 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP5P45974 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP5P45974 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP5P45974 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP5P45974 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP5P45974 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP5P45974 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP5P45974 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP5P45974 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
USP5P45974 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP5P45974 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP5P45974 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP5P45974 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP5P45974 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP5P45974 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
USP5P45974 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP5P45974 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms