Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGIRP43119 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms