Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTGFRP43088 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTGFRP43088 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms