Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTTP42858 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HTTP42858 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTTP42858 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HTTP42858 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTTP42858 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTTP42858 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTTP42858 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTTP42858 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTTP42858 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTTP42858 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTTP42858 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTTP42858 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTTP42858 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTTP42858 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTTP42858 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTTP42858 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTTP42858 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTTP42858 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTTP42858 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTTP42858 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTTP42858 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTTP42858 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTTP42858 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTTP42858 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HTTP42858 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTTP42858 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HTTP42858 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTTP42858 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTTP42858 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTTP42858 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTTP42858 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTTP42858 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTTP42858 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HTTP42858 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTTP42858 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HTTP42858 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTTP42858 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HTTP42858 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTTP42858 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTTP42858 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HTTP42858 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HTTP42858 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HTTP42858 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HTTP42858 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HTTP42858 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTTP42858 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTTP42858 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTTP42858 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTTP42858 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTTP42858 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTTP42858 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTTP42858 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTTP42858 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTTP42858 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTTP42858 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HTTP42858 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTTP42858 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTTP42858 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTTP42858 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTTP42858 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTTP42858 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HTTP42858 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HTTP42858 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTTP42858 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTTP42858 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTTP42858 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTTP42858 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTTP42858 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTTP42858 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HTTP42858 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTTP42858 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTTP42858 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HTTP42858 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTTP42858 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTTP42858 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTTP42858 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTTP42858 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTTP42858 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTTP42858 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTTP42858 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTTP42858 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTTP42858 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTTP42858 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTTP42858 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTTP42858 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTTP42858 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTTP42858 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTTP42858 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTTP42858 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HTTP42858 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTTP42858 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTTP42858 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTTP42858 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HTTP42858 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HTTP42858 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HTTP42858 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HTTP42858 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HTTP42858 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HTTP42858 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms